南方医科大学前身为中国人民解放军第一军医大学，创建于1951年，1979年被确定为全国重点大学，2004年8月整体移交广东省，更名为南方医科大学。学校是广东省高水平大学重点建设高校中唯一的医学院校，全国首批、广东省唯一一所“部委省”共建高校，全国首批开设八年制本硕博连读临床医学专业的8所高校之一，全国首批卓越医生教育培养计划试点高校。现有10个博士学位授权一级学科，8个博士后科研流动站，拥有5个国家重点及培育学科。拥有国家、省部级科研平台93个，科技部重点领域创新团队2个、教育部创新团队2个、国家自然科学基金创新研究群体1个。现有13所直属附属医院，17个国家临床重点专科。
南方医科大学中医药学院（原第一军医大学中医系）始建于1975年，目前拥有中西医结合、中医学、中药学三个一级学科，其中一级学科博士学位授权学科2个，一级学科硕士学位授权学科1个。开设了中西医临床医学、中医学、针灸推拿学、中药学4个本科专业和3个特色班，其中中西医临床医学、中医学和中药学为国家一流专业建设点。拥有博士后流动站1个，建有国家重点学科1个，国家中医药管理局重点学科6个，国家中医药管理局重点专科4个，国家中医药管理局科研（三级）实验室3个，国家中医药管理局“治未病中心”1个，广东省攀峰重点学科1个，广东省中医药管理局重点专科7个，广东省重点实验室1个，广东省工程实验室1个，广东省工程技术研究中心2个，广东省创新团队1个。拥有直属中西医结合医院、南方医院中医科、珠江医院中医科等9家学校直属附属医院临床平台。

南方医科大学中医药学院（原第一军医大学中医系）始建于1975年，目前拥有中西医结合、中医学、中药学三个一级学科，开设了中西医临床医学、中医学、中药学、针灸推拿学4个本科专业及3个特色班；拥有博士后流动站1个，一级学科博士学位授权学科2个，一级学科硕士学位授权学科1个。建有国家重点学科1个，国家中医药管理局重点学科6个，国家中医药管理局重点专科4个，国家中医药管理局科研（三级）实验室3个，国家中医药管理局“治未病中心”1个，广东省攀峰重点学科1个，广东省中医药管理局重点专科7个，广东省重点实验室1个，广东省工程实验室1个，广东省工程技术研究中心2个，广东省创新团队1个。拥有直属中西医结合医院、南方医院中医科、珠江医院中医科等9家学校直属附属医院临床平台。