福建医科大学附属第二医院始建于1881年，原名“惠世医院”，为英国教会医院。1973年整建制划归福建医科大学，更名为福建医科大学附属第二医院。医院是福建省首批通过卫生部评审的四家三级甲等综合医院之一，是我省主要的医疗、教学、科研、毕业后教育基地之一，是博士、硕士研究生学位授权点单位、国家级博士后科研工作站。是国家省级区域医疗中心、福建省呼吸医学中心。医院在全国三级公立医院绩效考核评价中连续三年进入全国前10%，等级A+。医院荣获第六届“全国文明单位”荣誉称号。
医院设鲤城和东海两个院区，鲤城院区占地24.57亩，东海院区占地322.6亩；医院编制床位2000张，年门急诊量175万人次，住院量9万人次，总手术量9万余人次，其中住院手术7.5万人次，跻身“2020中国综合医院手术量百强榜”。现有员工3000余人，其中高级职称422人，博、硕士700人,医师中具有博士、硕士研究生学历占总数近70%，博士生导师20人，硕士生导师129人，教授、副教授138人。在国际学会任理事、委员等学术任职2人，国家级学（协）会委员以上学术任职90人次、省级学（协）会副主任委员以上学术任职43人次。医院是海峡两岸医药卫生交流协会海西介入呼吸病学专业委员会、中国残疾人康复协会康复工程与辅助技术专业委员会视障辅助技术专业学组挂靠单位。
医院历来以外科技术精湛著称，上世纪四、五十年代率先在泉州地区开展大、中型外科手术，并为泉州地区培养了大批医学骨干力量。近年来，医院学科建设取得长足发展，呼吸与危重症医学科被列入国家临床重点专科，介入呼吸病学、低视力康复、产前超声医学等亚专科跃入国内先进水平。医院是福建省呼吸医学中心挂靠单位，免疫学和变态反应专业、皮肤病专业、超声诊断专业、肿瘤科（中西医结合）、普通外科、麻醉科、内分泌科、眼科、临床护理等9个专科被列入省级临床重点专科。
医院设鲤城和东海两个院区，鲤城院区占地24.57亩，东海院区占地322.6亩；医院编制床位2000张，年门急诊量175万人次，住院量9万人次，总手术量9万余人次，其中住院手术7.5万人次，跻身“2020中国综合医院手术量百强榜”。现有员工3000余人，其中高级职称422人，博、硕士700人,医师中具有博士、硕士研究生学历占总数近70%，博士生导师20人，硕士生导师129人，教授、副教授138人。在国际学会任理事、委员等学术任职2人，国家级学（协）会委员以上学术任职90人次、省级学（协）会副主任委员以上学术任职43人次。医院是海峡两岸医药卫生交流协会海西介入呼吸病学专业委员会、中国残疾人康复协会康复工程与辅助技术专业委员会视障辅助技术专业学组挂靠单位。
医院历来以外科技术精湛著称，上世纪四、五十年代率先在泉州地区开展大、中型外科手术，并为泉州地区培养了大批医学骨干力量。近年来，医院学科建设取得长足发展，呼吸与危重症医学科被列入国家临床重点专科，介入呼吸病学、低视力康复、产前超声医学等亚专科跃入国内先进水平。医院是福建省呼吸医学中心挂靠单位，免疫学和变态反应专业、皮肤病专业、超声诊断专业、肿瘤科（中西医结合）、普通外科、麻醉科、内分泌科、眼科、临床护理等9个专科被列入省级临床重点专科。
